为了适应江苏高等药学教育及地方经济发展的需要，充分发挥药学学科的独特优势， 1995年9月，原镇江医学院增设药学专业，并招收了第一届药学专业大专生；1996年4月，经江苏省教育委员会批准，在临床医学专业增设本科药学方向，学制四年，同年9月，筹建了原镇江医学院药学系，并招收了首届药学专业本科生；1998年该专业获原国家教育委员会正式批准。2001年8月经教育部批准，原江苏理工大学、镇江医学院、镇江师范专科学校合并组建江苏大学，同年11月，江苏大学批准成立药学院，成为我省综合性大学中第一个独立设置的药学院。
药学院现设有药学和药物制剂两个本科专业，药剂学和中药学两个硕士学位授权点，下设两个系（药学系 和药剂系)、一个实验中心（药学中心实验室)和一个研究基地（新药研究基地)。现有在校本科生400余人，硕士研究生20余人。
学院现有教职工 25人，其中专业技术人员19人，正高职称4人，副高职称2人，具有博士学位教师5人，硕士学位教师6人，江苏省“青蓝工程”培养对象1人，江苏省“333”工程（第三层次)培养对象2人，江苏省医药高峰人才1人，镇江市有突出贡献的中青年专家1人。学院现拥有高效液相色谱仪、气相色谱仪、薄层扫描仪、行星式研磨机、激光粒度仪、喷雾干燥机、冻干机、高压均质机、红外分光光度仪、紫外分光光度仪等一批先进的进口精密仪器设备，为我院的教学科研提供了较好的条件。
学院坚持以本科教育为主体，积极发展研究生教育，以“教好书、育好人、创好药”的办学宗旨，通过学科交叉、渗透，努力创建特色专业与特色学科，不断提高办学质量与办学层次，创品牌、出效益，努力把我院建设成为省内有较大影响的教学研究型学院，为国家经济建设培养需要的高级药学技术人才。
学院在办学过程中，始终坚持教学工作的中心地位，教师教风严谨，学生学风优良，科研学术氛围浓厚。近年来学院承担国家 863项目子课题、国家自然科学基金重点项目子课题、江苏省青年科技基金、江苏省自然科学基金、江苏省科技攻关项目、省教育厅高新技术产学研项目和镇江市重点攻关等多项科研课题，总经费达一百多万元，通过省级鉴定4项，获省、市科技进步奖3项，发明专利2项，发表论文80余篇，SCI收录3篇，EI收录4篇，主编、参编专著10余部。
