安徽医科大学微生物学学科是安徽省省级重点学科，安徽省第一批“精品课程”和“重点课程”建设单位，是最早获取硕士学位授予权的学科之一，在我省乃至全国较有影响的学科。目前是省微生物与免疫学学会挂靠学科。在分子病毒学、人巨细胞病毒、呼吸道病毒、肠道病毒、优生优育、干扰素研究与开发等方面具有坚实的基础和较强的实力。
本学科一直进行医学微生物学的教学、科研、产品开发和应用研究。目前实验室总面积约1500平方米，有研究室、实验室、产品开发室、生物安全实验室、资料室、学术报告室等。拥有的仪器设备总价值约 414万元。目前有教授2人，副教授及相当专业技术职务者3人，讲师及相当专业技术职务者10人，其中具博士学位者4人，在读博士4人www.med126.com，其余专职教师均具有硕士以上学历。我们一直注重从教学工作、科研工作、人才培养、实验室建设等方面抓好学科建设。主讲的课程有《医学微生物学》、《临床微生物学和微生物检验》、《发酵工程》、《分子病毒学》、《细胞培养技术》、《病原生物学》、《形态学综合实验教程》、《微生物学进展》等，课堂教学中注重运用启发式、讨论式、研究式等教学方法和手段，通过教学内容的生动有趣的讲授去引起学生的学习兴趣和启发主动思维，使学生从被动转为主动。并根据学生原有的知识水平和学习能力以及后续课的需要把内容讲透，讲出课程的目的性和重要性；与科研和教学相结合讲清发展的方向和动态，科学规律发现的思维。我们将在继续开设高水平的研究生课程的基础上，争取在“十一五”期间，把研究生的《细胞培养技术》建成校级和省级精品课程。此外，还开展学生第二课堂，开展系列讲座，讲讲自己的科研工作部分；建立学生课外科研小组等。
专著出版方面，主编和参编人卫出版社、高教出版社、人民军医出版社等理论、实验教材10余部。完成教学论文5篇，被选为省学科带头人和省青年骨干教师各1人。
科研上承担的重要课题包括：国家自然科学基金二项，教育部科技研究重点项目一项，安徽省自然科学基金1项，安徽省“十五”重大科技攻关二项，安徽省“十一五” 重点科技攻关一项www.med126.com，安徽省高等院校高新技术成果转化重大项目一项，以及安徽省教育厅重点项目和合肥市科技局项目等。已取得多项成果，获得专利多项。其中获2004年度安徽省科学技术三等奖1项，累计发表论文100余篇。在CMV、VZV、EV71、动物干扰素等领域取得了诸多具有创新性的研究成果。通过科学发展，学科的科研能力和学术水平得到进一步提高，提高了在全国的知名度。
本学科长期以来高度重视人才培养，对年轻教师培养采取定向培养、自己培养、委托培养、跨学科培养等多种形式进行。经常开展学术讲座和讨论，聘请在国外有一定学术造诣的海外专家为学科兼职教授，邀请回国人员和国内有影响力的专家作学术报告，积极鼓励和支持他们参加全国性的学术会议。目前学科已形成年龄和结构较为合理的学术梯队，有一批技术骨干。开设高水平的研究生课程，指导硕士、博士研究生的课程学习，掌握本学科领域国内外的最新成果。2000年至今，已培养统招和在职硕士研究生20余名，均获硕士学位，其中多名考取国内博士研究生。目前教研室有硕士生导师4名，近几年每年招收硕士研究生5~7名。
在实验平台建设上，本学科拥有先进的仪器设备和较为宽敞的实验场地，有开展各种教学和科研活动的高新技术、经验、各种规范等。为做好生物安全防护，对一些专业实验室如生物工程产品实验室、细菌与病毒学实验室等安装了紫外线装置和空气净化系统，并配备了PII和PIII生物安全柜。实验室均具有完善的灭菌系统，并严格验证与验收规程，规范操作，确保对病原生物的彻底灭菌和安全排放，无环境污染。目前实验室的绝大多数科研和实验技术人员，都参加过卫生部、教育部以及其他相关部门所举办的生物安全培训班，并取得了相应的上岗证书。以初步建成设备齐全实用、布局科学合理、管理规范先进的适于各层面实验教学和研究的现代化实验平台。
