上海药物所是药学一级学科博士、硕士学位培养单位，2014年计划在药物化学、药理学、药物分析学、药剂学、药物设计学等五个专业招收学术型硕士学位研究生88名左右，在制药工程、药学硕士二个专业招收全日制专业学位硕士研究生10名左右。另代上海科技大学招收学术型硕士学位研究生25名左右。
一、培养目标
学术型硕士研究生旨在培养德智体全面发展，爱国守法，在本学科内掌握坚实的基础理论和系统的专门知识，具有从事科学研究、教学、管理或独立担负专门技术工作能力、富有创新精神的高级专门人才。
全日制专业学位硕士研究生面向社会需求，面向科技前沿，适应工程技术发展和创新需要，培养德智体全面发展，爱国守法，掌握相关专业领域坚实的基础理论和宽广的专业知识，具有较强的解决实际问题的能力，能够承担专业技术或管理工作，具有良好职业素养的高层次应用型专门人才。
全日制专业学位硕士研究生与普通学术型硕士学位研究生，在我国高层次人才培养中具有同等重要的地位和作用，属同一培养层次的不同类型。这种学位类型不同于以往的非全日制专业学位硕士，它不要求实际工作经历，需要通过全国研究生入学统一考试选拔录取，在导师指导下进行全日制脱产学习且具有学籍，毕业时达到培养要求者颁发硕士研究生毕业证和硕士专业学位证，双向选择联系就业并正常派遣。与普通学术型硕士不同的是，全日制专业学位硕士研究生主要面向社会应用需求进行招生和培养，在培养过程中更加侧重于专业技术技能和应用实践能力的培养，专业学位研究生不能进行硕博连读，但获得硕士学位后，可参加博士研究生公开招生入学考试。
二、报考条件
学术型硕士研究生和全日制专业学位硕士研究生采取“分列招生计划、分类报名考试、分别确定录取标准”的招生考试模式。
报名参加硕士研究生全国统一考试(含学术型硕士和全日制专业学位硕士)，须符合下列条件：
1．中华人民共和国公民。
2．拥护中国共产党的领导，愿为社会主义现代化建设服务，品德良好，遵纪守法。
3．考生的学历必须符合下列条件之一：
（ 1 )国家承认学历的应届本科毕业生；
（ 2 )已取得国家承认的大学本科毕业学历的人员（包括通过高等自学考试或国家承认学历的成人高校获得本科毕业文凭的人员)；
（ 3 )已获硕士、博士学位的人员（只能报考委托培养或自筹经费的硕士)；
（ 4 )达到与大学本科毕业生同等学力的人员。
其中同等学力人员是指：
① 获得国家承认的大专毕业学历后，满 2 年（从高职高专毕业到录取为硕士生当年的 9 月 1 日，下同)，达到与大学本科毕业生同等学力，且符合根据培养目标提出的具体业务要求的人员；
② 国家承认学历的本科结业生；
③ 成人高校应届本科毕业生。
4．年龄一般不超过 40 周岁（1973年8月31日以后出生者)。
5．身体健康状况符合规定的体检标准。
6．在校研究生报考须在报名前征得所在培养单位同意并出具证明；已退学的研究生须校验退学证明。
7．同等学力人员报考，还应具备下列条件：
① 已取得报考专业大学本科 8 门以上主干课程的合格成绩（由教务部门出具成绩证明或出具本科自学考试成绩通知单)；
② 已在公开出版的核心学术期刊发表过本专业或相近专业的学术论文（为第一作者)；或获得过与报考专业相关的省级以上科研成果奖（为主要完成人)；或主持过省级以上科研课题。
