江苏地处我国东南沿海，与日本山水相连，一衣带水。江苏的交通便利，医药与文化发达，人文荟萃。据史书记载，江苏历代医家和医著数量在全国名列前茅，影响波及海内外。古代江苏对日医药交流得天独厚，成就卓著。
据《汉书》、《后汉书》和日本的史书记载，公元前219年，秦始皇遣江苏籍方士徐福率百工和数千童男女东渡日本，传播了中医药技术。
南北朝·天嘉二年(561年)时，吴(今苏州)知聪携带《肘后备急方》等164卷医书赴日，在日本定居并传授汉医、针灸技术，此为中国医书直传日本的最早记载。知聪之子善那使主继承父业，于日·大化元年(645年)制牛
酪进献给孝德天皇，天皇赐以“和药使主”(医药权威之意)的称号，子孙世袭其职位。至清和天皇贞观六年(864年)，知聪的后裔和药使主黑麻吕与和药使安主、弟雄均受赐宿弥(天皇赐给亲近臣下的高贵姓氏)，可见知聪的子孙已成为日本很有影响的世医。
唐·天宝年间，广陵江阳县(今扬州)鉴真和尚接受了日僧邀清，在11年内6次东渡，谱写了中日医药交流史上最为激动人心的诗篇。天宝十二年(753年)鉴真一行24人，携带
麝香、
沉香、
甘松、
龙脑、
檀香、
安息香、毕拨、
诃黎勒、
胡椒、
阿魏等名贵药材从扬州出发，于次年2月到达日本奈良。
鉴真精通医学，抵日后治愈了光明皇太后的疾病，皇室把备前国水田一百町赐予鉴真。尽管鉴真当时双目失明，但他利用嗅觉、味觉及手的触觉，将有关药物的鉴别、收藏、炮炙、使用、配伍等知识传授给日本人民，日圣武天皇的侍医韩广足(时任全国典药头)也随鉴真学习药物技术。浅田惟常在《皇国名医传》中指出：自鉴真东渡面授医药知识，得使日本“医道益辟”。14世纪以前，日本医界把他奉为始祖，直至德川时代，日本药袋上还贴有鉴真的肖像。
隋唐时期，中国医书大量输入日本，其中江苏医籍占有较大比例。如宇多天皇宽平三年(891年)藤原佐世奉敕登记日本图书，撰成《日本国见在书目》，书中收载医书166部，1107卷。由江苏(含客居江苏)医家所著的有15部，100卷，约占总数的1/10。其中有徐文伯的《杂药方》1卷，僧深的《方集》29卷，葛洪的《肘后方》9卷，胡洽的《胡洽方》3卷，鉴真的《鉴上秘方》1卷，陶弘景的《本草经集注》7卷，龚庆宣整理的《刘涓子鬼遗方》11卷等。成书于公元984年、日本现存最早的综合性大型方书《医心方》，引用中国方书160余部，现在能列出书目的84部中，作者为江苏医家的就有14部，如《陶弘景本草注》、《华佗方》、《药对》、《徐伯方》、《葛氏方》、《抱朴子》等。
宋元时期，中日医药交流较少。至明清时期，中日两国政府间和民间往来较密切，医药交流增多。明·洪武二年(1369年)日本国藤原氏之裔竹田昌庆来明习医，学成归国时带去
牛黄丸制作技术。竹田昌庆因为医术超群，又有专科技能，逐渐成为日本的名医，后因治疗日本北朝后园融天皇病患有功，任左卫门督。竹田昌庆有三子，直庆、善庆、昭庆均善医，后子孙继承祖业，成为日本新的医学世家。
明朝航海业发展较快，中外医药交流远达30多个国家和地区。明朝正德、嘉靖年间，日本来中国学习医药者较多，其中成就卓著的要数日本医学中兴之祖曲直濑道三，他于正德年间来中国习医，1545年学成归国到了京都，后在洛下创办了日本医学教育史上具有重要意义的医学校——启迪院，历时20年，培养了大量汉医人才。1574年，曲直濑道三撰写完成日本第一部察证辨治全书——《启迪集》，书中记载引用了大量的中国医籍，被引用次数最多的10部医书中有江苏医家周文采(吴人)的《医方选要》和长期客居江苏的陈自明(曾在南京任建康府教授)所著的《妇人大全良方》。《启迪集》为日本后世派的代表作，曾一度被日本人视为金科玉律而崇奉。
清朝中日商船往来频繁，经江苏沿海将大量的汉书输入日本。据日·大庭修《关于江户时代唐船持渡书之研究》中内阁文库之《唐蛮货物帐》记载，进入长畸的中国商船常有大量的书籍。江户时期中国出版的书籍百分之七八十以上都传到日本，而且速度很快，一本新书问世，大约不出几个月即可运到日本。
这一时期江苏医家去日本传授医学的也较多。据查阅考证，1719年至1726年，苏州就有3位医师先后赴日。吴载南，1719年3月东渡，寓长崎福济寺，传授医学，并施仁术于民。陈振先，1721年6月去长畸，在日本期间，跋涉长崎山野，采集药草162种，著《陈振先采药录》。赵淞阳，1726年10月赴日，曾为日本名医香月牛山撰的《药笼本草》作序，香月在书信中称赵为“国手”，1729年10月归国。以后，又有崇明籍医家周南应邀去日本。周在日期间撰成《其慎集》5卷(1725年)，书中收载病例62例，病种以内科为主，另有外科、妇科、眼科等，附录部分有关医药问题答日人问，共12条。苏州医家胡振于1803年应日本幕府之邀去长崎，日本医师大田南亩曾奉幕府之命向胡振学习药方，小川汶庵、千贺道隆、吉田长祯等人随从胡振学习，后皆成为著名的幕府医官。明清赴日的中国医师有详细记载者27人，其中江苏医家就有5人。
清·乾隆年间，琉球(日本)医生吕风仪闻常熟名医曹存心医术高明，还善于带教，有弟子数十人，便于道光四年(1824年)毅然来中国拜曹为师，行弟子礼。3年学成归国，5年后(1832年)吕又将历年临床上所遇疑难病症，收集整理，书信求教，曹氏为之逐条剖析，并以此集成《琉球百问》、《琉球问答奇病论》，寄给日本弟子。书中涉及内、外、妇、儿各科，强调辨证论治，对质疑之问题实事求是，后被传为中日医药交流史上的佳话。
江苏医药界自古就向国外开放，历代医家无私地把医药理论和丰富的临床经验，甚至秘方、秘诀、制药工艺、宝贵医籍介绍到国外，或亲自出使，或带外国弟子，或信函往来，解难答疑。尤其是扬州高僧鉴真先后6次东渡的壮举，在中日医药文化交流史上留下了光辉的一页。
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