南京中医药大学第二临床医学院以培养针灸推拿、中医美容、运动医疗保健、营养与食疗、中西医结合康复等方面专业人才为主要方向，设有针灸基础、针灸临床、推拿、实验针灸学、中医美容、养生康复教研室和针药结合实验室、教学实验中心、以及针灸研究所、气功研究所等机构，并为国家职业技能鉴定所挂靠单位。针灸学科先后被评为国家教育委员会、国家中医药管理局、江苏省重点学科及江苏省重点实验室。本院是全国针灸进修教育基地和国际针灸培训中心的教学单位，是全国首批确定的针灸推拿硕士点、博士点 和 博士后流动站；也是康复医学和理疗学硕士点。针灸学科先后成为国家级重点学科、国家中医药管理局局级重点学科建设单位、江苏省针灸学重点学科，针药结合实验室为国家级重点实验室培育点。
第二临床医学院是集教学、科研和医疗为一体的教学单位，具有较为雄厚的教学实力。主要承担全校针灸推拿、中医美容、运动医疗保健、营养食疗、中西医结合康复的专业课程的教学工作，并有自己的临床教学实习基地。经过多年的努力，第二临床医学院在教材编写、教学质量、教研成果等诸多方面，均达到了国内先进水平，为我国第一至第五版统编教材《针灸学》的主编单位，规划教材《刺法灸法学》以及新世纪规划教材《针灸治疗学》、《实验针灸学》、《中医养生学》的主编单位。《针灸学》和《刺法灸法学》课程为江苏省级优秀课程，《实验针灸学》和《养生康复概论》为校级优秀课程。《针灸学》课程群获江苏省优秀课程群称号，《推拿学》获校优秀课程群称号。学院针灸研究所下设分子生物学研究室、电生理研究室、组织形态研究室、生物化学研究室、同位素室和针灸临床研究室等，具有较为完备的研究设施，承担多项国家级、省级科研课题，是省内最大的针灸研究机构。 医学全在.线网站www.med126.com
多年来第二临床医学院以针灸重点学科为龙头，不断拓展专业方向，在人才培养、教材建设、师资培养、文献整理、临床医疗、科学研究以及外事教学等方面作出了显著成绩，处于国际、国内的领先地位。
